电子商务在航空运输领域的应用集中在电子客票，电子客票是航空运输电子合同的表现。电子合同是一种采用数据电文形式的书面合同，承诺人通过数据信息形式发送要约，采用到达生效主义，承诺一经到达要约人处合同当即成立，并经承诺人确认生效。但是电子客票在中国现行航空法律框架下不是“客票”，其订立程序也和现行法律规定有冲突，有待通过已经颁布的，于2010年7月1日实施的《中华人民共和国侵权责任法》解决。按照我国《人民法院的司法解释》“新法优于老法”的观点，我们相信有了法律的保障，我国在航空领域的电子商务会发展得更好。
特种规定
1.凡对人体、动植物有害的菌种、带菌培养基等微生物制品，非经民航总局特殊批准不得承运。
2.凡经人工制造、提炼，进行无菌处理的疫苗、菌苗、素、血清等生物制品，如托运人提供无菌、证明可按普货承运。
3.微生物及有害生物制品的仓储、运输应当远离食品。
4.植物和植物产品运输须凭托运人所在地县级（含）以上的植物检疫部门出具的有效"植物检疫证书"。
5.托运人要求急运的货物，经承运人同意，可以办理急件运输，并按规定收取急件运费。
航空运输业是一个高投入的产业，无论运输工具，还是其他运输设备都价值昂贵、成本巨大。因此其运营成本非常高，航空运输业由于技术要求高，设备操作复杂，各部门间互相依赖程度高，因此其运营过程中风险性大。任何一个国家的政府和组织都没有相应的财力，像贴补城市公共交通一样去补贴本国的航空运输企业。出于这个原因，航空运输业在世界各国都被认为不属于社会公益事业，都必须以盈利为目标才能维持其正常运营和发展。
航空运输企业经营的形式主要有班期运输、包机运输和专机运输。通常以班期运输为主，后两种是按需要临时安排。班期运输是按班期时刻表，以固定的机型沿固定航线、按固定时间执行运输任务。当待运客货量较多时，还可组织沿班期运输航线的加班飞行。航空运输的经营质量主要从水平、经济效益和服务质量3方面予以评价。