1.打开太阳能热水器进水口；
2.太阳能热水器除垢剂加入到存水箱；
3.自动热循环20-30分钟，使除垢剂溶液充分接触各部位；
4.打开排水口，排干清洗液；
5.将水箱加满水后再循环两分钟；
6.排干循环水，清洗除垢工作完成。
真空管内的水垢会影响加热效率，水垢越厚加热越慢，所以会有太阳能热水器使用时间越长，加热越慢的现象。清洗以后水垢消除，加热时间缩短，节省电费。水垢会占用水箱容积，水垢厚了，能储存的热水量就少了。去除水垢，水箱的热水储存量就能越来越多。
磁化除垢法：磁化法水处理是使水流通过一个磁场，然后再流入管道或太阳热水器系统，经过磁力线切割后，水中的钙镁盐类不能结垢或不能结成坚硬的水垢，而是形成微小的颗粒，随水流动。磁化除垢是通过磁化方式将已有的水垢清除的过程。磁化除垢的机理有两个方面：一方面是在磁力作用下，水垢晶体发生极化，降低了水垢的稳定性，使得水垢被不断地溶解，被水流冲走。
声学除垢法：声学除垢技术是在太阳能热水系统的设备内部激发和维持声频震荡，同时将声波传递给水介质进行除垢。超声波（1200～2500HZ）能使管道及设备的旧积垢逐渐剥落，并使硬度盐在水中结晶、并生成无粘性的粉末沉淀。