代理记账的收费方式也有不同，有的是按月，有的是按年。所以在进行了解的时候一定要确定方式，其实按年一次性缴纳费用，这种方法是比较划算的。
事实上，对于不同的企业来说，其记账报税工作量大小不同。有些企业生产经营规模较小，且业务类型较为单一，因而财务工作处理相对轻松，其代理记账价格也相对较低。但对于企业规模较大，且业务类型较为复杂的公司来说，由于其在日常经营往来过程中产生的票据量较多，所以其账务处理工作也会相对繁重，代理记账价格自然也会相对高些。
一般的代理记账公司会接手客户全部的财务处理，即有关财务的全部内容。主要有银行、工商、税务、公积金以及社保等方面的财务处理。而财务代理就有所不同。财务代理一般按照财务模块分开，既可以负责整个完整的多模块财务处理，也可以负责部分的单个或多个模块的财务处理。
财务代理更倾向于对委托公司的发展负责。其中主要包括完成委托事务、完善项目和优化企业财税以及谋求企业更好的发展。而代理记账公司一般是以委托公司给予的账目记录清楚并且完整无误的报账为服务标准。